Illustrator(イラストレーター)のレイヤー結合できない理由です。
Illustrator(イラストレーター)のレイヤー結合できない理由

サブレイヤーとは、レイヤーの中にあるレイヤーのことでオブジェクトの「重なり順」を表しています。
注意ポイント
これは、サブレイヤーであって通常のレイヤーではなくオブジェクトの最小単位の表示ですので「レイヤー」として結合できません。
レイヤーを結合する方法

レイヤーが同時選択できます。
次に、レイヤーウィンドウの右上のアイコンをクリックします。
「選択レイヤーを結合」を選べば、今同時選択しているレイヤーが結合できます。
サブレイヤーはレイヤー結合できないので覚えておきましょう。
【完全版】イラレレイヤーの使い方!整理、複製、順番、結合、削除方法!!
サブレイヤーに頼るな!

その理由はレイヤー結合できないなどの他、色々とサブレイヤーに依存すると作業効率が下がるからです。
オブジェクトの「重なり順」はショートカットで処理します。
レイヤー構造はシンプルにし、同じファイルを操作する「他の人」も一発でわかりやすいレイヤー状態で仕上げるのが理想です。